Primero has una copia de todo tu directorio home (/home) a alguna partición o algún disco de almacenamiento externo. Ten en cuenta de incluir los directorios y archivos ocultos. También guarda tu
Luego necesitas una lista de todas las aplicaciones instaladas para eso puedes usar el siguiente comando:
sudo dpkg --get-selections > /home/user/package.selections
Esa lista guárdala igual que tu directorio home.
Una vez que tengas tu instalación limpia, copia el package.selections a tu home. Luego copia tu sources.list en el directorio /etc/apt actualiza los repositorios según la distro que estas usando por ejemplo gutsy a intrepid.
Ejecuta los comandos:
sudo aptitude update
sudo dpkg –set-selections /home/package.selections && apt-get dselect-upgrade
Esto hará que se instalen tus aplicaciones. Después que se hayan instalado copia tu home copiado hacia tu home nuevo, no olvides de los archivos ocultos.
Recomendación: es mejor tener el directorio /home en una partición aparte, cosa que para estos casos ya no tienes que hacer una copia. También has una copia del directorio /etc usando el comando tar para conservar la estructura de permisos.
Fuente.
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